Енисейский Спасский мужской монастырь основан около 1592 г., утвержден архиеп. Тобольским Герасимом (Кремлевым) в 1642 г. С 1764 г. - 3-го класса необщежительный мужской монастырь.

Главный храм - Спасский, каменный, заложен в 1731 г., освящен в 1756 г. Трехпрестольный Покровский храм с приделами св. прор. Божия Илии и св. Иоанна Крестителя, надвратный храм свв. правв. Захарии и Елисаветы с приделами в честь иконы Божией Матери «Всех скорбящих Радость» и свт. Алексия, митр. Московского (1785 г.).

Закрыт в 1920 г., подвергся разрушениям.

В 1937-1938 гг. на территории монастыря происходили массовые расстрелы.

С 1990 г. начато его восстановление.