Никольский греческий мужской монастырь был основан в XIV в., а в документах впервые упомянут в 1390 г. как монастырь "Никола Старый", "Никола большая глава, что у крестного целованья". Первоначально он располагался на месте совеменного дома 11 в Ветошном пер. В его соборе приводили к присяге подсудимых в сомнительных случаях, потому у него было название "что у крестного целованья".

1556 г. - Иван Грозный позволил останавливаться в Никольском монастыре монахам- грекам, приезжавшим в Москву.

1653 г. - царь Алексей Михайлович отдал монастырь "для приезжих греческих властей и старцев и гречан для отправления божественной службы греческим языком" (монахам Афонского монастыря). Привезенная с Афона чудотворная икона Иверской Божьей матери вначале находилась в монастыре. Позже икона была перенесена в специально построенную часовню у Воскресенских ворот Китай-города.

Никольский греческий монастырь стал центром небольшой греческой колонии. Имел книгописную мастерскую.

В 1713 г. князь Дмитрий Кантемир начал строить новый каменный одноэтажный Никольский собор в память своей жены Кассандры. В 1714 г. строительство было остановлено в связи с постройкой Санкт-Петербурга и закончено только в 1724 г.

В 1735-36 гг. над собором сооружена церковь Успения Пресвятой Богородицы иждивением семьи князя Кантемира.

В 1770 г. была построена церковь св. Константина и Елены на средства кн. Матвея Кантемира.

В 1799 г. главный собор вновь был перестроен.

В 1893-1895 гг. по периметру владения монастыря и по красной линии улицы строятся новые каменные здания по проекту архитектора К.Ф.Буссе. Эти здания монастырь сдавал внаем разным учреждениям.

В Никольском монастыре располагалась религиозная библиотека, собранная А.И.Хлудовым.

В 1918 г. монастырь был закрыт. В настоящее время колокольня бывшего греческого Никольского монастыря приписана к главному собору бывшего Заиконоспасского монастыря.