Церковь Николая Чудотворца в Аксиньино построена в 1865-1874 годах вместо деревянного Никольского храма. Деревянный храм стоял на другом месте, восточней, над рекой (разобран в 1876 году).

Первоначально главный престол новой каменной церкви был Троицкий (сейчас Никольский), придел в трапезной Никольский (сейчас Троицкий), так же в церкви есть Покровский придел.

В 1937 году при советской власти церковь была закрыта.

В 1990 году возвращена верующим и открыта.