Носовский-Стефановский приход был открыт в 1668 году по благословению патриарха Иосифа II в селении Носова гора (позже именовалось Носовское, Стефановское, иногда писались оба эти названия через дефис). Первая деревянная церковь была освящена во имя святых Богоотец Иоакима и Анны и по ней приход именовался Богоиоакимовским.

Приход входил в состав подгородной вотчины домового патриаршего Череповецкого Воскресенского мужского монастыря. В 1770 году первая деревянная церковь сгорела. В 1775 году на ее место была поставлена перевезенная деревянная церковь во имя святителя Леонтия Ростовского из вотчины Ростовского архиерейского дома села Богородское, и переосвящена во имя св. Богоотец Иоакима и Анны. В 1788 году освящена построенная каменная холодная церковь в память Обновления храма Христа в Иерусалиме (Воскресения Словущего). В настоящее время она руинирована.

В 1814 году освящена построенная каменная тёплая церковь во имя св. Богоотец Иоакима и Анны с приделами во имя Святителя Николая и Пророка Илии, существующая в настоящее время. При церковной реформе 1869 года Носовский приход причислен к 5 классу. Причта было положено священник и псаломщик.

Между церквами находилась восмигранная, шатровая, столпообразная колокольня, построенная во второй половине 18 века одновременно со строительством Воскресенской церкви, разобранная в конце 1930-х годов вместе с окружавшей храмы и приходское кладбище каменной оградой в позднеклассическом стиле и каменной сторожкой на юго-западном её углу.
Иоакимо-Аннинская церковь в 1930-х годах являлась центром благочиния, подчинявшегося Череповецкому Окружному епархиальному викариатскому совету ведения Московской патриархии.