Рождественский мужской монастырь основан около 1398 года монахом московского Симонова монастыря Ферапонтом между Бородавским и Пасским озерами (ныне село Ферапонтово Вологодской области). В 16 веке значительный культурный центр.

В 1798 году упразднен, восстановлен в 1903 (1904-?) году как женский монастырь.

В 1924 году закрыт, в монастыре размещён музей.

Сейчас филиал Кирилло-Белозерского историко-архитектурного и художественного музея-заповедника. Часть зданий Ферапонтова монастыря передана Русской православной церкви. Службы совершаются в надвратных церквях Ферапонтова монастыря, в летнее время — в церкви преподобного Мартиниана. 16 июня 2018 года с предстоятельским визитом Ферапонтов монастырь посетил Патриарх Московский и всея Руси Кирилл, высказавший пожелание возродить полноценную монашескую жизнь в стенах обители.

------------------------------

Богородице-Рождественский собор построен в 1490 году на месте прежнего деревянного, освящённого еще преподобным Ферапонтом. Церковь двухпрестольная с Никольским южным приделом. В 1502 году за 34 дня весь собор Рождества Богородицы был расписывается известнейшим художником Дионисием и его сыновьями. Фрески Дионисия почти полностью сохранились до нашего времени - это одно из чудес Божьих. Такой степени сохранности столь древних росписей нет больше ни в одной обители. Более древние росписи и сохранявшиеся во всей полноте были в Никольском храме на Волотовом поле. Они погибли во время бомбежек Новгорода в Великую Отечественную войну.

Благовещенская церковь построена в 1530-1534 годах. Звонница располагалась в третьем ярусе храма. Позже колокола из Благовещенской церкви перенесены в построенную в XVII веке монастырскую колокольню.

Богоявленская надвратная домовая церковь построена в 1649 году. Церковь отведена патриарху Никону.

Ферапонта Белозерского надвратная церковь построена в 1649 на одними двойными святыми воротами с Богоявленской надвратной церковью.

Мартиниана Белозерского церковь-усыпальница преподобного Мартиниана Белозерского построена в 1640-1641 годах.