Согласно архивным данным, вопрос о постройке храма в городе был поднят казачеством 12 августа 1882 года при содействии церковнослужителя Павла Белоярова, который возглавлял православную церковь в г. Кульдже (Китай). На счету Белоярова имелось 4000 рублей, и еще 5000 рублей пожертвовал купец Сомов, но этих средств было недостаточно, поэтому постройка храма затянулась. Лишь в 1892 году в городе, наконец, появилась русская православная церковь. Здание было построено из дерева (тянь –шаньской ели) на каменном фундаменте, с наружной и внутренней штукатуркой, покрыто листовым железом, с несколькими куполами и колокольней. Во времена советского лихолетья храм был закрыт и использовался местными властями для хозяйственных нужд. Лишь в 1991 году церковь была возвращена верующим. 17 мая 1992 года, ровно через сто лет после возведения храма, настоятелем был назначен священник Павел Иванов (ныне игумен Вианор). Храм вновь был освящен 26 июля 1994 года архиепископом Алматинским и Семипалатинским Алексием.
В храме имеются мощи священномученика Василия (Колмыкова), иерея Джаркентского и иже с ним убиенных Джаркентских новомучеников, обретение мощей которых состоялось 26 апреля 2002 года на кладбище станицы Подгорненской (ныне пос.Кыргысай). В настоящее время мощи священномученика Василия, канонизированного в 2000 году на Юбилейном архиерейском соборе, и пострадавших с ним 14-ти православных христиан (пока не канонизированных, материалы собираются) размещены в деревянной резной раке с сенью. Написана икона с изображением всех 15-ти мучеников. У раки с мощами регулярно совершаются молебны. Планируется выпустить печатное издание, в которое войдут житие, акафист и икона святых мучеников. В храме также имеются частицы мощей святителя Иннокентия, епископа Иркутского, преподобномучеников Алматинских Серафима и Феогноста; священноисповедника Николая (Могилевского). Имеется чтимый старинный образ Матери Божьей, именуемый «Всех скорбящих радосте», икона святителя Николая, Мир Ликийских Чудотворца, принадлежавшая старосте храма с.Подгорного мученику Зосиме (Фунтикову) и переданная в день обретения святых мощей его внучкой Стариковой Верой Игнатьевной. По ее словам, священномученик Василий (Колмыков) всегда молился перед этим образом, а потому в икону врезан нательный крестик отца Василия.
В период с 1956 по 1970 годы в г. Панфилове (ныне Жаркент) проходил свое пастырское служение протоиерей Григорий (Ухань), пострадавший в годы репрессий. Житийную справку об этом священнике можно найти в епархиальном архиве.
В храме имеется небольшая духовная библиотека, фонд которой периодически пополняется. Дети, обучающиеся в воскресной школе, и другие прихожане регулярно пользуются духовной литературой. Воскресную школу посещают 35 детей, они изучают Закон Божий и рисование. Стало традицией проводить в храме рождественскую елку с инсценировками, конкурсами, праздничным концертом. Еще одна традиция нашего прихода – посещение погранотряда, полка и отдаленных погранзастав с целью окормления военнослужащих. Оказываем духовную поддержку, совершаем таинства, молебны, проводим беседы.
Ведется постоянное окормление Дома инвалидов, оказываем им не только духовную, но и материальную помощь. К празднику Рождества каждый год привозим им подарки, а также собираем и раздаем одежду малоимущим. В последнее время в связи с обнищанием населения все таинства в храме совершаются для малоимущих безвозмездно.