В 1905 году на почитаемом месте построили небольшую часовню. В 1914 году построена церковь Николая Чудотворца рядом со святым источником, который забил на месте обретения иконы Николая Чудотворца.

В 1929 году часовню и церковь закрыли, разрушили, засыпали пещеры и родник. Почти все монахи, священники и активные прихожане арестованы. По приговору суда шесть человек, в том числе и монах со Святой Горы Афон Иван Дорофеев, расстреляны. Приходские священники Серафим Белов и Александр Корин получили длительные сроки заключения без права дальнейшего проживания на европейской территории РСФСР. 79-летнию старицу Евгению приговорили к восьми годам строгой изоляции. Осуждены были все члены приходского совета и ряд крестьян, активно помогавших подвижникам.

В 1980-е годы установлен крест. Построена небольшая часовня.

В 1990-е годы Вавилов Дол становится центром паломничества верующих Самарской и Саратовской епархий. Где стоял Никольский храм, возведена часовня, обустроены колодец и купальня для паломников. В часовне хранится список имен убиенных священников и мирян Вавилова Дола.