Храм во имя Святителя Николая (Горно-Никольский) построен в 1751 году на средства брянских купцов Кольцовых вместо прежнего деревянного храма, который существовал еще в XIV веке и неоднократно перестраивался.

Изначально храм был трехпрестольным: центральный престол освящен в честь Святителя Николая, правый – в честь Святого Апостола и Евангелиста Иоанна Богослова, левый – в честь Безсребренников и Чудотворцев Космы и Дамиана. В первой половине ХIХ века возведена нынешняя колокольня, заменившая первоначальную.

После октябрьского переворота храм был закрыт. В 1964 году разобраны завершения здания, сделан ряд пристроек и заложены проемы колокольни. С 1971 по 1982 год храм был на реставрации, но одновременно приспособлен под брянский областной планетарий.

В 1993 году был воссоздан Православный приход, однако здание храма приходу передали только 3 декабря 1999 года.

На основании ходатайства Епископа Брянского и Севского, в 2002 году приход храма был преобразован в Горно-Никольский мужской монастырь. 18 декабря 2010 года были совершены чинопоследования освящения Престола и обновления храма. Указом правящего Архиерея храму был определен статус Соборного храма Горно-Никольского монастыря.

В июле 2012 года было начато строительство братского монастырского корпуса для проживания монашествующих.