Начало строительство каменной пятиглавой церкви в 1674 году при Ростовском митрополите Ионы Сысоевича, на его средства при образовании здесь им монастыря. Завершено строительство при его преемнике Иоасафе в 1694 году. Придел Флора и Лавра.

В 1764 году монастырь упразднён, церковь обращена в приходскую.

В начале 1960-х годов церковь закрыли.

В 1996 году храм возвращен верующим.