Церковь Николая Чудотворца на Шапше упоминалась в окладной книге от 1618 года.

Большая Богородицерождественская деревянная церковь построена в 1762 году. Главный престол Рождества Пресвятой Богородицы освящен в 1762 году. В 1767 году освящен придел Святых Бессребреников Космы и Дамиана. Церковь не сохранилась.

Каменная Николаевская церковь построена в 1769 году. Главный престол Святителя Николая Чудотворца архиепископа Мирликийского, приделы Преподобного Феодосия Тотемского и Преподобного Димитрия Прилуцкого (отапливался). Обновлённый Димитриевский придел освящен 30 октября 1866 года. В 1865 году при церкви открыто приходское попечительство.

В советское время храм закрыли. Храмовая часть и алтарь не сохранились.

Церковь возвращена верующим. В 2013-2015 годах на колокольне установлен купол со шпилем и крестом.