В 1628 году упоминается деревянная Никольская церковь. В 1645—1647 годах упоминается две деревянных церкви Никольская и Троицкая с Пятницким приделом. В 1673 году часть прихода отделилась, в селе Ковалеве построена Троицкая церковь. На начало 18 века в селе две деревянных церкви тёплая Троицкая и Никольская, в 1719 году церкви сгорели. В 1720 году построена деревянная Троицкая церковь. Никольская деревянная построена в 1738 году. В 1763 году Никольская холодная церковь сгорела, на месте ее в том же году построена новая деревянная церковь с престолом во имя Николая чудотворца. В 1836 году на средства прихожан возобновлена, к 1860-м годам она пришла в ветхость и богослужение в ней прекращено. В 1875 году в Омутецком приходе отведено новое кладбище, Никольская церковь перенесена туда и в 1877 году освящена во имя Введения во храм Пресвятой Богородицы, не сохранилась. Тёплая деревянная Троицкая церковь, построенная в 1720 году, существовала до конца XVIII столетия и посему обветшала.

В 1790 году с разрешения епископа Владимирского Виктора начата постройка каменная церковь. Храм построен и освящен в 1802 году. В 1842 году построена колокольня.

В 1850-1868 построена новая кирпичная Троицкая церковь. Храм с колокольней и трапезной, в ней Покровский и Никольский приделы. Главный престол освящен 18 августа 1868 года, придельные престолы освящены в 1855 году. В 1878 году в приходе открыта земская школа. В 1885 году открыта церковно-приходская школа.

В 1933 году церковь закрыли. Во второй половине ХХ века здание храма использовалось под мастерские Второвской ЛМС.

Церковь возвращена верующим.