Храм построен в 1781 на средства купчихи Т. И. Суровщиковой, с использованием части стен и подклета каменного храма 1657, который был перестроен в 1721. Предшественник храма 1657 — деревянный (первое письменное упоминание в 1620). Находился на правом берегу реки Яузы, около ее устья, в Старых Серебряниках, «что в Денежных мастерах», около слободы ремесленников — «серебряников», чеканивших царскую серебряную монету. Главный престол- Живоначальной Троицы, приделы в трапезной — Казанской иконы Божией Матери и святителя Василия Великого. В 1764—68 на средства прапрадеда Н. Н. Пушкиной (жены поэта), владельца полотняной фабрики А. А. Гончарова, чья усадьба с севера граничила с церковным участком, построил новую, отдельно стоящую колокольню, на месте разобранной старой. В ее средней части устроен храм Усекновения главы Иоанна Предтечи, «для всегдашнего поминовения родителей» (арх. К. И. Бланк). Обновлялся в 1830-х, 1890-94 (в 1891 расширена трапезная), 1910. В XIX в. пристроено крыльцо. В конце XIX в. coopужена ограда с воротами в русском стиле с киотом для иконы.

Храм в стиле барокко с классицистическим оформлением боковых фасадов. Однокупольный с широкой ротондой, увенчанной небольшой главкой на тонком гранёном барабане. Портик с колоннами. Основа здания — неравносторонний восьмиугольник с примыкающими к нему прямоугольными боковыми частями — трапезная, алтарь, образующими крестообразную форму. Лепнина на восьмиугольных стенах — церковные символы (крест, якорь, книга и др.). Меандровый фриз — в виде бегущей волны. В храм ведет каменная лестница. Ярусы колокольни почти не убывают по высоте, что создает впечатление массивности. Колокольня — одно из лучших произведений московского барокко середины XVIII в. Строилась как самостоятельный храм. Обилие колонн, карнизы, разорванные фронтоны. Закрыт в 1930-х. Размещены производственные цеха, склад студии «Диафильм». Возвращен РПЦ. Храм в колокольне вновь освещён в 1993.