Построен в 1706-11 (по др. источникам 1698-1711) на месте деревянного храма (возведённого в 1639 стрельцами в их слободе при царе Михаиле Федоровиче). Каменный, пятиглавый, бесстолпный (главный престол — Спаса Преображения), с однобокой трапезной с приделом святителя Николая Чудотворца и примыкающей к ней шатровой колокольней. В 1763 в ю.-з. углу трапезной построен придел архангела Михаила. В 1812 разграблен наполеоновскими войсками, церковные дома сожжены. Обновлялся в 1743 (трапезная), 1849 (устроен западный вход перед колокольней), 1892.

В 1849 обнесен оградой с воротами. Одновременно построены к северу от колокольни ризницу и притвор в русском стиле. В 1891 ворота соединили с колокольней, coopужён парадный портал с новым большим притвором. Портал - фигурный, полуколонки с кольцом или дынькой. В основаниях барабанов глав — кокошники с декоративными раковинами и килевидными завершениями.
Пилястры — бочкообразные. Сквер за храмом разбит в 1871 на средства Н.Львова (внука известного архитектора) и назван Пушкинским в память о частых посещениях поэтом арбатских переулков (перепланирован в начале 1970-х).

В 1928 национализировано большинство церковных зданий, где размещались церковно-приходская школа, богадельня. Изъяты ценности. Закрыт в 1930-х. В 1979-90 в нем находилось одно из объединений киностудии «Союзмультфильм». Внутреннее убранство утрачено. В 1979 произведен внешний ремонт.

В 1990 передан РПЦ.
При храме — группа милосердия, работает библиотека.