Как свидетельствуют некоторые источники, в 1669 году деревянная церковь во имя Архистратига Михаила в селе была отстроена заново.
В переписных книгах Московского уезда 1675 года, говорится: "...в Сетуньском стану в монастырских вотчинах написано: вотчина Новодевичья монастыря село Тропарево, а в нем храм Чудо Архистратига Михаила древен".
Церковь возводилась клетями (срубами). О том, как она выглядела в те времена, можно, наверное, судить по картине художника Б. Черушева.
Год от года богател Новодевичий монастырь, и в 1693 году в Тропарево вместо сгоревшей деревянной церкви построили сохранившийся и поныне каменный пятиглавый храм Михаила Архангела с шатровой колокольней и одноэтажной трапезной, с приделами в честь Происхождения Честных древ Креста Господня и мученика Харлампия (в нем хранятся частицы мощей этого святого). Вот почему видим мы тут не скромную сельскую церковку, как, скажем, в соседнем Конькове, а пятиглавый храм с шатровой колокольней работы большого мастера.
Тропаревский храм был построен в стиле церковной архитектуры конца XVII века. В то время произошел переход от трехглавия (украинский стиль) к пятиглавию по-московски. Этот стиль часто называют "Нарышкинским барокко", поскольку в имениях князей Нарышкиных в то время были сооружены церкви подобного типа. Их характерная деталь - сочетание форм, привычных для русских православных церквей, и новых, более пышных элементов декоративного убранства, во многом навеянных западной архитектурой, которая проникала тогда в Россию - живописным декоративным убранством и строгой многоярусной структурой. В ряде исследований такой стиль получил название "московского барокко".
Храм был хорошо виден издалека и, располагаясь с правой стороны от Боровской дороги, привлекал внимание проезжих людей, направлявшихся в Москву с юго-запада.
После постройки новой церкви ей выдавался антиминс - освященный четырехугольный плат из льняной или шелковой ткани, на котором изображается положение Христа во гроб, а по углам помещается изображение четырех евангелистов; в верхнюю часть обычно вшивается частица мощей. В книге Патриаршего приказа о выданных антиминсах за 1694 гг. значится: "октября в 25 день... дан антиминс к освящению церкви Чуда Архистратига Михаила в Московский уезд, в село Тропарево; взял антиминс той же церкви поп Иоанн и за антиминс росписался".
К началу XVIII века в селе было выстроено сорок новых дворов. После постройки каменного храма в селе находились "двор монастырский, двор скотный... и 40 дворов крестьянских, в них 147 человек". В церкви служили "поп Иван Васильев и дьячек Иван Иванов".
В переписи 1718 г. упоминается каменная церковь Михаила Архангела; Никулино также упоминается как принадлежавшее Новодевичьему монастырю. По переписи (ревизской сказке) 1748 года в Тропареве проживало 118 человек.
В то время село находилось еще во владении Новодевичьего монастыря и представляло собой образец хозяйственного управления. В книге "Новодевичий монастырь в Москве" историка И.М.Снегирева приводится следующее описание:
"В образец хозяйственного управления приведем ведомость деревни или подмосковного села Тропарева: "село Тропарево с деревнями, в них последнее - в 1744 году ревизии крестьянских 225 душ, к тому селу и деревням по писцовым дачам земли паханной и лесом поросло 590 четвертей...конюшенных припасов: веников 425 гнезд, сенных покосов 405 копен, лесу непашенного 15 десятин, заповедных три рощи осиновых на 40 десятин, дубовые рощи на 10 десятинах. Земли на монастырь находилось 28 десятин в поле, а в двух по томуж. В монастырь высылалось в феврале 12 человек колоть лед на Москве-реке... 10 баб для рубки капусты и для чищения свеклы. Работники были при своем пропитании." При Тропареве находились кельи для приезда властей монастырских, также сад и при нем садовник. Скотный двор, при коем было монастырского скота: коров 4, подтелков 2, бык 1, телят 6, овец 7".
Приведенное описание еще раз подтверждает, что село Тропарево было одной из богатых вотчин монастыря и занимало особое положение среди окрестных селений.
На протяжении "монастырского" периода храм поддерживался в хорошем состоянии. Это видно по описаниям конца XVIII века (сразу после выхода села из-под монастырской опеки): "Московский округ, Пехрянские десятины, село Тропарево, в нем церковь во имя святого Архистратига Михаила, каменная, в твердости, утварно посредственна, церковь большая. Священник Симеон Федоров, указ имеет".
Многие села и деревни, расположенные в юго-западных окрестностях Москвы, были разорены во время нашествия Наполеона в Россию в 1812 году. Хотя Тропарево находилось на достаточном удалении от Смоленской дороги, по которой наступали французы, ему также был нанесен ущерб. Возможно, это произошло при отступлении наполеоновской армии по Старокалужской дороге (ныне - Ленинский проспект). Пострадал и храм Архангела Михаила. Приведем прошение священника тропаревской церкви Василия Симеонова, написанное в ноябре 1812 года: "...В нашу Архангельскую церковь многократно входили супостаты и чинили святотатства, как-то, в ризнице и со святых икон серебряные венцы и оклады с престолов как настоящего храма, так и придела происхождения честных древ, одежды... посняли, и церковный архив передрали, с придела же сосуды и святый антиминс похитили, а в настоящей Архангельской церкви сосуды и святой антиминс имеется в целости; почему и прошу Вашего преосвященства повелеть настоящий храм освятить и о сем учинить Архипастырское решение... ". Решение епископом Дмитровским Августином было принято незамедлительно и через несколько дней храм в соответствии с чиноположением был освящен.
Согласно источникам, храм впоследствии был отремонтирован. Как свидетельствуют "Клировые ведомости церквей Московского и Богородского уезда" 1822 года, крыша храма была покрыта железом и выкрашена зеленой краской, а сама церковь и колокольня - желтой.
В XX веке храм в Тропарево не избежал участи многих российских монастырей и храмов. В 1936 году внутреннее убранство храма было разорено. В таком виде церковь простояла более полувека, периодически используясь под различные хозяйственные нужды: в ней размещались то зернохранилище, то склад декораций киностудии "Мосфильм", то производственный цех монументальной чеканки. Временные хозяева практически не заботились о ней, и постепенно церковь приходила в запустение и разрушалась.
Накануне войны, в 1939 году, по словам очевидцев была совершена последняя литургия, и храм закрыли, перекрыв духовный источник этой местности. Колокола были сброшены с колокольни и, все кроме одного, впоследствии возвращенного храму, бесследно исчезли.
Долго пребывал храм в полузапустении и полузабытьи. В 1988 году, когда отмечалось 1000-летие Крещения Руси, вышло постановлением московских властей о церковь Архангела Михаила в Тропареве была передана в пользование Московской Патриархии Русской Православной. Московский Патриархат принял решение придать ему особый статус - Патриаршего подворья. Церковь Архангела Михаила стала второй по счету (после Свято-Данилова монастыря) из храмов, возвращенных верующим в годы "перестройки".
Освящение храма провели 23 февраля 1989 года. Освящение храма приурочили к 23 февраля 1989 года. В этот день отмечается праздник священномученика Харалампия. Настоятелю храма отцу Георгию удалось найти бережно сохраняемую людьми икону святого с частицей его мощей. Жители района ждали этого события, но войти в храм удалось лишь за два дня до освящения. Всего за два дня и две ночи жители, которые двадцать лет добивались возвращения храма, успели разобрать завалы мусора и вынести из храма горы хлама. После того как расчистили главное помещение, был сделан временный иконостас и состоялось освящение. Еще сырой и холодный храм освятил митрополит Ростовский и Новочеркасский Владимир, управляющий делами Московской Патриархии, с благословения Патриарха Московского и всея Руси Пимена. Этот день можно считать днем возрождения храма, который с этого момента вновь стал действующим. Начались службы, началось восстановление.
К тому моменту, когда верующим вернули святыню, храм трудно было узнать: на куполах и в стенах зияли дыры, фрески практически не сохранились. "Первое, что я сделал, - говорит отец Георгий, - позолотил купола и кресты, а их общая площадь - 125 кв. м, это значит 250 книжек тяжелого золота. Долги, конечно, потом долго отдавал. Это можно считать дерзостью' храм полуразрушен, вокруг непроходимая грязь, в буквальном смысле слова, по колено (я на службу приезжал в резиновых сапогах), а купола сияют и кресты на них, как отрада людям, - возрождение началось!" Когда храм был готов для росписи, работы в нем проводил художник Виктор Павловичем Мясоедов.
Через год произошло маленькое чудо: помимо колоколов, специально отлитых доя храма на одном из уральских заводов, церковь Архангела Михаила вновь обрела один из прежних собственных колоколов, который был сброшен безбожниками с колокольни в дни закрытия церкви в годы советской власти. Этот колокол был подобран, спрятан и сохранен одной благочестивой прихожанкой, жительницей села Тропарево. В возвращении колокола храму приняла самое деятельное участие труппа Театра на Юго-Западе во главе с главным режиссером В.Беляковичем; этот театр - одно из плодородных зерен русской культуры, достойная внимания достопримечательность современного Тропарева.
В последующие годы сделано многое - построен дом причта с крестильным храмом и библиотекой, воскресная школа, в которой обучается 150 детей. построены отдельные домики-киоски для продажи церковной утвари.
Сегодня в храмовый комплекс входят уже несколько построек. Это дом с крестильным храмом, с библиотекой и читальным залом, с просфорной и кабинетом протоиерея. Заново расписана трапезная храма, рядом здание воскресной школы, два кирпичных киоска - иконный и книжный. Восстановлены по чертежам. Святые парадные ворота, за церковью выстроен мемориал в память о всех, кто некогда был похоронен на церковном кладбище, которое в 39-м сровняли с землей. В честь 50-летия победы в Великой Отечественной войне 1941-1945 годов все имена погибших воинов-тропаревцев были выбиты на каменных досках, а перед ними установлен памятный крест.
Здание имеет симметричную композицию, состоящую из двухсветного пятиглавого четверика с трёхчастной апсидой, трапезной и трехъярусной шатровой колокольни. Среди подобных памятников в ближайших окрестностей церковь выделяется удлинёнными пропорциями бесстолпного четверика, завершённого кокошниками, имитирующими закомары, и "глухими" 2-ярусными барабанами глав, усиливающими выразительность силуэта здания. Детали архитектурного декора - колончатые с навершиями-гребешками оконные наличники, укрупнённые угловые колонки, карнизы нескольких типов - очевидно, навеяны формами построек Новодевичьего монастыря, сооружённых в 1680-х гг. Среди декоративных элементов храма можно выделить барочные детали: восьмиугольные и двухъярусные шеи глав, убранство стен "пилою" (декоративное оформление верхнего фриза), а также особый рисунок железной решетки в окнах второго этажа. Стройная и изящная колокольня, представляющая собой два четверика, несущих восьмерик звона, увенчанный шатром с окнами-слухами, по своей композиции и набору декоративных деталей более тяготеет к архитектуре середины XVII в. Возможно, она является самой ранней частью здания, сохранившейся от предшествующей церкви. Об этом же свидетельствует характер примыкания колокольни к кладке западной стены трапезной, осуществлённой с "перебивкой" карнизов.
21 ноября храм в Тропарево отмечает свой престольный праздник - день памяти святого Архистратига Божиего Михаила. Этот праздник был установлен Православной Церковью еще в IV веке.
Архангел Михаил почитается как предводитель небесного воинства, борющийся против сил зла (в переводе с греческого архистратиг - "верховный военачальник"). Изображение на иконах Архангела Михаила имеет символический смысл и выражает разного рода почитания.
В древнерусском искусстве Архангела Михаила обычно изображают в двух вариантах: в одном - Архангел предстает в придворном облачении с лорантной лентой ("лор" или "лорум" - широкая и длинная полоса ткани, расшитая жемчугом и драгоценными камнями), в руках он держит сферу (зерцало) и жезл, одет он в хитон и гиматий; в другом - изображается как воин, Архистратиг небесных сил - в правой руке - поднятый меч, а в левой руке - ножны, он облачен в плащ и длинную кольчугу. Почитание такого типа изображения Михаила Архангела было распространено на Руси с XIII века, об этом свидетельствуют его изображения на печати великого князя тверского Михаила Ярославовича (стоит отметить, что Архангел Михаил считался покровителем князей и ратной славы), на фреске церкви Успения в Волотове, на соборной иконе в Архангельском соборе Московского Кремля.
По этому же типу написана и храмовая икона Архангела Михаила в тропаревском храме, она расположена справа от царских врат. Образ Архистратига Михаила передает чувство уверенности в победе, убеждение это создается радостным цветовым созвучием разнообразных оттенков красного цвета.
В храме освящены два престола: первый, с южной стороны, созданный в 1789-1791 гг. - во имя происхождения Честных Древ Животворящего Креста Господня и второй, с северной стороны, основанный в 1858 году - Священномученика Харлампия. Отмечаются одноименные Храмовые праздники - соответственно 14 августа (во имя происхождения Честных Древ Животворящего Креста) и 23 февраля (в честь Священномученика Харлампия). В Харлампиевском приделе хранится икона с частицами мощей этого святого, которая в день праздника выносится для поклонения. Придел во имя происхождения Честных древ Животворящего Креста Господня был создан и освящен после перенесения иконы из домовой церкви того же наименования, существовавшей в селе Воронцово у князя П.И.Репнина.
В храме, по разные стороны от царских врат, находятся списки с двух чудотворных икон Божией Матери - Смоленской (Одигитрии) - слева, и Донской- справа, являющейся святыней.
Список с Донской иконы особо почитаем в храме, так как жившие в Тропарево сподвижники Дмитрия Донского и их потомки всегда считали ее своей заступницей. Каждый год 1 сентября (19 августа по старому стилю) Донская икона Божией Матери торжественно выставляется в честь своего праздника в храме перед верующими.
Традиция почитания Смоленской иконы Божией матери, называемой "Одигитрия", пришла в храм из Новодевичьего монастыря, в чьи владения, как уже упоминалось, входило Тропарево. Тропаревский список сделан, по всей видимости, с иконы XVII века. Глядя на него, невольно вспоминаешь сказания о чудотворной силе иконы. В 1398 году, во время нашествия Тамерлана на южные пределы России, иконою Смоленской Божией Матери князь Витовт благословил дочь свою Софию, супругу князя Василия Дмитриевича, бывшую в Смоленске для свидания с отцом, и ею перенесена была икона из Смоленска в Москву и поставлена в Благовещенском соборе. Помогала она и во времена нашествия Наполеона. Накануне Бородинской битвы икону носили по лагерю, чтоб укрепить молитвою воинов к великому подвигу. Особо чтимых списков с этой иконы насчитывалось когда-то более 3 тысяч, они хранились в церквях Москвы и других городов.
