Построена в 1895-97 (арх. А. П. Попов) в Новой Деревне (Курская канава, между Новой и Проломной улицей), около Рогожской заставы, на средства братьев В. А., П. А. и А. А. Бахрушиных. Приделы храма были освящены во имя их небесных покровителей: главный престол — Василия Исповедника, правый придел — апостолов Петра и Павла, левый — мученика Александра. Четырехстолпный, с восьмигранным куполом (с окнами), круглой главой. Над папертью была coopужена трехъярусная шатровая колокольня. В 1906 худ. П. Ф. Соколов расписал интерьер храма.

В 1922 власти изъяли свыше 6 пудов серебряных церковных ценностей и утвари и более пуда медных денег. В 1935 году храм закрыт.

После 1945 года полностью перестроен. Колокольня разрушена до первого яруса, купол, глава и крест снесены, здание надстроено, внутри сделаны перекрытия для трех этажей. В 1967 сбит декор и заштукатурены стены. В храме размещался архив, затем банк.

3.XII.1998 года состоялось малое освящение храма. При храме открыта воскресная школа.
В 2006 г. состоялось первое после открытия храма архиерейское богослужение архиепископа Арсения Истринского в престольный праздник преподобного Василия Исповедника.