Храм построен в 1652—65 (по другим источникам 1652—57) на средства прихожан на месте деревянного храма, существовавшего в Бронной слободе государевых мастеров-оружейников (бронников) с начала XVII в. (первое письменное упоминание — 1615).

В 1694 с сев. к главному престолу Иоанна Богослова пристроен придел святителя Николая Чудотворца, состоящий из отдельного здания с трапезной и алтарем. В 1740—42 coopужена трехъярусная колокольня (на месте старой, XVII в.), в 1838 освящен придел святителя Митрофана, епископа Воронежского (с правой стороны главного престола). В начале 1840-х проводились строительные и ремонтные работы. По их окончании, в 1842, храм вновь освящен.

Тип небольшого посадского храма. Двусветный, в плане четырехугольный, вытянутый с сев. на юг. Пятиглавый. В центре - световой барабан на сомкнутом своде, с дополнительными цилиндрическими сводиками, на которые опираются по углам
глухие боковые главы. С зап. примыкает трапезная, двусветная, четырехугольная, с характерными для нарышкинского стиля наличниками с разорванными фронтонами. Имеет троечастную алтарную часть. Увенчана главкой на двухъярусном восьмигранном барабане. К трапезной примыкает колокольня (ее нижний ярус — притвор) в стиле барокко, с легкой изящной лепниной.

В 1922 власти реквизировали ценности (церковная утварь, иконные ризы и др.).

Закрыт в 1933. Неизвестна судьба святынь – чудотворной Смоленской иконы Божией Матери и святого апостола Иоанна Богослова с дарственной надписью царя Михаила Федоровича (1615). Разрушены купола и барабан. В помещении храма находились мастерские Драматического театра им. А.С.Пушкина.

В 1970-х начались реставрационные работы. Отреставрированы порталы с килевидным верхом. На фасаде Никольского придела обнаружены фрагменты живописи, остатки орнамента.

Возвращен РПЦ в 1992. На Пасху в 1993 возобновлено богослужение в Никольском приделе. В 1995 здание освобождено от столярных мастерских. Освящен архиерейским чином 21.V. 1999.

Храм — памятник древней московской архитектуре— единственная церковь, сохранившаяся на Тверском бульваре.