При осаде Новгорода в 1170 году новгородский архиепископ выносит на крепостную стену икону Богоматери, в нее ударяется стрела, и на Богородичном лике появляются слезы. В тот же момент гнев небесный покарал наступавших. Одержав решающую победу, новгородцы установили с той поры праздник Знамения Пресвятой Богородицы.

На одном из колоколов церкви Знамения Богоматери надпись "подаянием приходских людей" датировалась 1600 годом. Но первый храм появился еще раньше. В самом начале XVII века он упомянут в протоколах допросов сторонников Дмитрия Самозванца. Под пыткой один из них признавался: "…который де вор назывался царем Дмитрием… с Москвы, от Знаменья Пречистыя из-за конюшен попов сын Митка".

Церковь возвышалась на углу Знаменки и Большого Знаменского переулка. Каменный храм упоминается в 1657 году, колокольня в 1667-м, но основательно перестраивалась, в том числе в XVIII веке, когда добавилась трапезная. Позднейшие "обновления" изрядно подпортили и храм, и колокольню.

1930 год вошел в историю страны постановлением ВЦИК о раскулачивании. В Москве в этот год был закрыт последний монастырь - Даниловский - и запрещен колокольный звон. Неожиданность впечатления сформулировал Осип Мандельштам: "Без голоса Иван Великий / Как виселица прям и дик". Колокола свозили на электролитный завод и переливали для треста "Рудметаллторг". В 1931 году требующая исследования и реставрации церковь Знамения Богородицы была снесена, и теперь вместо нее площадка для автомобилей Министерства обороны.