Деревянная церковь в честь Рождества Богородицы с Димитровским приделом построена в 1722 году на средства Ф.А. Плещеева.

В 1738 году по прошению полковника А.Г. Плещеева выдана храмозданная грамота на строительство каменного храма. Попечением семейства оного полковника храм построен и в 1754 году освящен придел святителя Алексия, Митрополита Московского. Новая трапезная с Никольским и Алексиевским приделами и колокольня пристроены в 1808-1813 году

В 1835 году территория храма была обнесена оградой на каменных столбах с трехчастными воротами и часовней. На погосте до последних лет сохранялись надгробия разного времени, в том числе над могилами владельцев: Плещеевых, Четвериковых.

Метрика 1887 года фиксирует облик церкви, вероятно, еще до перестроек: “... приделы - на правой стороне во имя Святителя Николая, а на левой - во имя Святителя Алексия..., алтарь по окны облицован белым камнем;... подзоры деревянные;... кресты медные, вызолоченные, восьмиконечные;... пол в храме и приделах чугунный, а в алтаре - лещадный; ... иконостас нового устройства с колоннами, резной, на белом поле, о пяти ярусах, в приделах в один ярус...; церковь расписана живописным письмом частями...”

В середине ХIХ века село Анискино принадлежало помещикам П.М. Губину и О.В. Кареевой. Здесь были небольшие ткацкие фабрики купцов Кожевниковых и Кошелева. В 1890-1917 годах Анискиным владел крупный фабрикант С.И. Четвериков.

Церковь закрыли в 1938 году. После 1941 года в здании храма размещались цеха ткацкой фабрики и склады. С 1970-х годов церковь заброшена и постепенно пришла в полное запустение.

В 1990 году храм передан церкви. 16 февраля 1990 года была отслужена первая Божественная Литургия в сторожке около развалин храма, а на Благовещенье этого же года в самом храме.

Храм полностью отстроен, в 1998 году освящен.