Деревянная церковь в честь Покрова Божией Матери была построена в сельце Макеево в 1695 г. стараниями князя Федора Ивановича Мещерского, чьим именем назвали потом село.

Сохранившиеся в усадьбе Мещерское постройки связаны с именем знаменитого зодчего, барона
Л.К.Боде, чей труд навсегда запечатлей в облике
Московского Кремля. В январе 1815 г. он женился на
Н.Ф.Колычевой, которой принадлежало Мещерское.
Боде построил здесь барский дом, флигель «теремок»,
башенку с воротами и оградой.

В 1853 г. он перестроил и домовую Покровскую, церковь. Рядом с вей находится часовня-усыпальница владельцев усадьбы.

В 1891 г. Московская земская управа выкупила имение под психиатрическую больницу, которой руководил доктор В.И.Яковенко. В конце XIX в. в Мещерском достроены больничные корпуса и вспомогательные помещения.

Покровский храм стал больничным. В 1906 г. церковным старостой в нем был врач, директор больницы М.П.Глинка. В Покровско-Мещерской школе в 1900 г. законоучителем являлся священник Сергей Васильевич Георгиевский, учительницей — Л.И.Яковенко.

В советское время Покровский храм закрыли, его пятиглавие разрушили. Он был перестроен, разделен перекрытием на два этажа. В здании открыли кафе.
В Мещерском сохранился усадебный дом, готическая башня, хозяйственные корпуса и остатки парка.

В наше время храм возвращен верующим. С 1994 г. в нем начались богослужения и активно проводятся восстановительные работы.