Справка 1855 г. о Никольской церкви села Кувекино сообщает, что построена она «кем и когда неизвестно, зданием каменная, грунт тверд», глинистый, с каменной колокольней, крытой железом. Престол в ней один — во имя святителя Николая. К Никольской церкви приписана Покровская Церковь села Яковлеве.

В архивах имеется план построения колокольни за 1828 г.
В документах 1856 г. отмечается, что церковь имела белокаменную трапезную, однако «по древности своей темна, сыра, в стенах трещины». В 1857-1858 гг. на строительство новой церкви в Кувекино крестьяне пожертвовали около 1000 рублей. Храм был выстроен по проекту архитектора Григорьева и освящен в 1880 г. во имя святителя Николая.
С 1912 по 1915 гг. в храме проходил служение в должности псаломщика Петр Ворона, расстрелянный
11 декабря 1937 г. (прославлен в Соборе новомучеников и исповедников Российских).

В 1930-е гг. храм закрыли и разграбили. Некоторые иконы приспособили под двери в скотник. В здании храма сделали зернохранилище, в трапезной устроили клуб. Крест с колокольни пытались стянуть лошадьми. Крыша над храмом с пятью куполами была сожжена, но своды чудом уцелели. Несколько храмовых икон находятся в Троицком соборе Подольска.

С 1996 г. в храме возобновлены богослужения. Силами прихожан и благотворителей ведутся реставрационные и строительные работы.