Хатунь на реке Лопасне – одно из самых древних поселений Подмосковья. В XII в. это была крепость на границе Рязанского княжества. Окружавшие ее валы сохранились до нашего времени. В начале XIV в. Хатунь утратила оборонное значение и превратилась в дворцовое село, центр волости. Позднее оно переместилось несколько выше по течению реки. До конца 1960-х гг. внутри крепостных валов стояла деревянная церковь в честь Воскресения Христова на Городище. Церкви в честь Рождества Божией Матери и во имя великомученика Георгия на посаде, также деревянные, существовали до начала XVII в. В 1497 г. жители Казани выгнали правившего ими Магмет-Аминя, ставленника великого князя Московского. Иван III, чтобы удовольствовать Магмет-Аминя, дал ему в поместье Серпухов, Коширу (именно так она тогда писалась) и Хатунь, к бедствию жителей, которым он был ненавистен своей алчностью и злобным нравом. Хатунская волость позже принадлежала Долгоруковым, затем А. Г. Орлову-Чесменскому.

В 1785 г. его иждивением построена ныне существующая каменная церковь в честь Рождества Пресвятой Богородицы с приделами во имя святителя Николая Чудотворца и в честь Воскресения Христова. Трапезная между храмом и колокольней построена в 1820-х годах. Хатунь к началу XX в. превратилась в большое торговое село.

В советское время, в 1937 году, храм закрыли. Разрушены колокольня и завершение храма, в трапезной устроен второй этаж и прорезан ряд окон. В помещении храма размещался детский дом.

В 1989 г. храм передан общине верующих и восстанавливается. Полностью восстановлены центральный свод и колокольня.