Село Парфеново упоминается в архивных документах, начиная с XVII века. В 1628 году здесь уже стоял деревянный храм в честь Богоявления Господня. Существующую каменную церковь с колокольней начали строить в 1810 году на средства местного помещика Петра Астафьева. Строительство окончили в 1813 году. В 1830 году над могилой храмоздателя (с северной стороны) был построен придел в честь святителя Петра, митрополита Московского. Третий придел в честь Тихвинской иконы Божией Матери был устроен на южной стороне трапезной части.

В XIX веке село входило в состав Переяславского уезда Владимирской губернии. Церковь просуществовала без значительных перестроек и утрат до закрытия в 1926 году. Последние настоятели - иерей Сергий и иерей Александр. Диакон Иоанн был убит, по рассказам старожилов, со всей своей семьей.

В настоящее время обрушен купол со шпилем на колокольне, утрачена кровля, разрушено перекрытие придела. Реставрационные работы находятся в начальной стадии. Согласно архитектурному паспорту здания храма, это один из интересных памятников позднего классицизма Сергиево-Посадского района, с развитой системой декорации фасадов и одновременно сохраняющий архаичные приемы перекрытия сводов. Хорошо найденные пропорции выделяют здание храма из числа других памятников этого времени.

Свод восьмерика был расписан под небо, под окнами - три евангелиста (четвертый изображен не был), восточная стена была занята образом "Христос во славе ". На западной стене четверика были изображения "Введение во храм Пресвятой Богородицы " и "Крещение Господне ". На западной стене придела - "Погребение митрополита Петра ". В настоящее время в храме совершаются водосвятные молебны с крестным ходом на престольные праздники: Богоявление, Тихвинскую икону Божией Матери и память святителя Петра митрополита Московского. 9 июля 2003 года, в день празднования Тихвинской иконы Божией Матери, была совершена первая после 1926 года Божественная Литургия, накануне - Всенощное Бдение. Причащалось 35 человек.

Настоятелем храма по совмещению является протоиерей Владимир Янгичер.