Деревянная церковь была в селе приблизительно с XVI века.

Кирпичная церковь с трапезной и колокольней, построена в 1789 году (основной объём выстроен (?) в 1739 году). Сергиевский придел (боковой) пристроен в 1888-1889 годах.

В 1934 году в Троицкий храм погоста Чижи назначен священник Николай Александрович Архангельский. 6 октября 1937 года его арестовывают по подозрению в антисоветской агитации и заключают в тюрьму города Ногинск. 3 ноября тройкой при УНКВД по Московской области выносится приговор по статье 58-10 УК РСФСР «ведении антисоветской агитации» с высшей мерой наказания. 5 ноября отца Николая расстреляли на полигоне Бутово под Москвой, похоронили в общей могиле. 16 января 1989 года реабилитирован Прокуратурой Московской области по 1937 году репрессий. Причислен к лику святых новомучеников и исповедников Российских Архиерейским Собором Русской Православной Церкви в августе 2000 года для общецерковного почитания.

После ареста священника церковь закрыли, заброшена, часть перекрытий обрушилась.

Храм возвращен верующим. С 2007 года начаты работы по восстановлению. В 2009 году церковь разобрана полностью. Колокольня сохранилась от старой церкви. На месте разобранной в конце XVIII века деревянной церкви, построен в 2009 году часовенный столп. В 2008-2009 году построена деревянная Свято-Троицкая церковь с шатровой крышей и обходной галереей-гульбищем. В 2012 году построена водосвятная часовня у чтимого Троицкого источника. На месте старого каменного храма во второй половине 2010-х годов построена новая кирпичная Свято-Троицкая церковь.