Преображенская церковь села Спасского-на-Нудоли впервые упоминается в 1627 году.

Первоначально храм был деревяным с приделом пророка Илии. В 1791 году освящен каменный храм, который неоднократно перестраивался в XIX-м веке.

Последняя перестройка храма произошла в 1911 году.

В 1934 году храм был закрыт.

В 1992 году храм был передан церковной общине, регулярные богослужения начались в день Благовещания 1993 года.