Древнее село Мещерино на реке Северке впервые упомянуто в духовной грамоте великого князя Димитрия Донского (конец XVI в.). Фельдмаршал Борис Петрович Шереметев получил Мещерино в наследство от дяди, Петра Васильевича Шереметева (Меньшого), который стоял во главе Поместного приказа.

Храм в честь Рождества Божией Матери построен Б. П. Шереметевым в конце XVII в. (предположительно в 1675 году). Возобновлен сыном Сергеем Борисовичем. Он уступил свою половину имения (свыше 35 тысяч душ) брату, а сам посвятил себя молитве и заботе о нищих. В церкви был иконостас, по преданию, подаренный Шереметеву папой римским, и древняя храмовая икона Рождества Божией Матери, у которой в 1691 г. произошло исцеление пять лет не ходившей женщины. В 1824 г. крепостной Шереметевых Яков Ермаков завел в селе ткацкую мануфактуру, которая стала самой большой в округе. Он выкупился на волю, а затем купил и само село. В 1843 г. Ермаковы пристроили к церкви трапезную и колокольню, потом к колокольне – здание богадельни. В 1895 г. Флор Яковлевич завещал свыше трех миллионов рублей для раздачи бедным «на помин его души».

В 1938 г. храм закрыли, устроив в нем склад. В 1967 г. здание переоборудовано под клуб.

В 1995 г. основной объем храма был передан общине верующих.