Монастырь, названный в честь святой преподобномученицы Великой Княгини Елисаветы, появился летом 1999 года в поселке Новинки Минского района (ныне территория г. Минска). Основой для монастыря послужило одноименное православное Сестричество, которое с 1996 года опекало Республиканскую клиническую психиатрическую больницу и городскую клиническую больницу № 2, а чуть позже — психоневрологический интернат № 3 для взрослых, Дом-интернат для детей-инвалидов с особенностями психофизического развития, туберкулезный диспансер, расположенные в Новинках, и интернат для детей с задержкой психического развития № 7 в г. Минске.