Нижний Новгород город, Окский съезд, 2-а.
История монастыря началась в XIV веке, когда тверская княгиня Анастасия вышла замуж за нижегородского князя Андрея. Ей было 12 лет, и она мечтала принять монашеский постриг и посвятить свою жизнь Господу, но не могла ослушаться воли родителей. В 24 года Анастасия овдовела. Князь Андрей, незадолго до смерти принявший монашеский постриг, был похоронен на территории Кремля в Спасо-Преображенском соборе.
Овдовев, Анастасия, в монашестве Феодора, организовала Зачатьевский монастырь (близ Кремля). Позже монастырь был перенесен и располагался между Георгиевской церковью (где ныне гостиница «Волжский откос») и Георгиевской башней Кремля. Обитель неоднократно подвергалась опустошению из-за пожаров, в пламени которых погибли и все документальные сведения о происходивших в те далекие времена событиях монастырской истории.
В 1811 году несколько обителей объединились, и игумения Дорофея начала хлопотать о перенесении монастыря за город. С 1813 года она приступила к устроению на новом месте обители. Так, на месте, где располагались Второе городское кладбище и Казанская церковь, построенная в конце 90-х годов XVIII века купцом Стешовым, обосновался Крестовоздвиженский женский монастырь. К 1821 году в обители проживали 22 монахини, не считая игумении и казначеи и 44 послушницы.
6 ноября 1815 года был освящен первый храм во имя иконы Божией Матери «Всех скорбящих Радость» и Василия Блаженного. Построенный вскоре Крестовоздвиженский собор имел форму креста. Центральный деревянный купол поддерживали внутренние пилоны с четырьмя малыми главами. Нижний этаж предназначался для склада церковной утвари. Церковь располагалась на втором этаже. Собор в честь Воздвижения Креста Господня освятил епископ Моисей в августе 1823 года.
В вопросе об авторе проекта монастырского ансамбля нет единого мнения. Некоторые приписывают авторство самой игумении Дорофее, славившейся умом, красотой и бескорыстием. Также мало сведений и о самой Дорофее. Известно, что родом она из богатого сословия. Овдовев, постриглась в монахини, оставив в миру троих детей. Сестры прославились своим рукоделием. Великолепие их искусства поразило посетившего обитель в 1834 году принца Ольденбургского. В 1839 году при монастыре была открыта школа для сирот, а в одном из сел — устроена богадельня.
К 1917 году в монастыре проживали более 100 монахинь, была своя больница, школа для подготовки регентов, мастериц-золотошвеек. Здесь же вплоть до революции находилась женская тюрьма, куда направлялись «для исправления» женщины различных сословий за всякие провинности, в том числе воровство и кровосмешение.
Сразу после издания Декрета об отделении церкви от государства монастырь был лишен всех прав. А в 1818 году при проведении учета монастырского имущества произошло столкновение между монахинями, прихожанами и представителями власти, повлекшее человеческие жертвы. Комиссар по церковному имуществу Карпов докладывал нижегородскому исполкому, что монастырский инцидент произошел «отчасти по вине монахинь, а главным образом по недоразумению стоящих на посту вблизи монастыря милиционеров».
А. И. Солженицын писал: «В петроградской «Красной газете» от 6 сентября 1918 года читаем, что первый концентрационный лагерь будет устроен в Нижнем Новгороде, в пустующем женском монастыре…». Это написано о Крестовоздвиженском монастыре.
Перед Отечественной войной площадь, на которой находился монастырь, была отдана горсоветом в распоряжение Медицинского института для строительства студенческого общежития, а монастырское кладбище было решено преобразовать в парк. Однако Казанскую церковь, как и кладбище (территория современной спортивной площадки), ликвидировали уже после войны. Между тем, на кладбище покоился прах многих выдающихся нижегородцев.
После закрытия монастыря бывшие его насельницы вынуждены были называться трудовой артелью и взять здание обители в аренду. В апреле 1923 года при Крестовоздвиженском соборе был зарегистрирован приход, при котором, в частности, как значилось в документах, «некоторое время состоял служителем культа» митрополит Сергий (Страгородский).
Именно здесь будущий Святейший Патриарх Московский и всея Руси отбывал арест в конце 1926 — начале 1927 года.
В 1927 году монастырь был переименован в «военный городок имени Климента Ворошилова». В 1928 году все насельницы обители были выселены с территории монастыря. Община перешла в Казанский кладбищенский храм, который был также закрыт в 1935 году. В советские времена в соборе располагались сначала склады, затем завод. В корпусах — многочисленные учреждения. На территории кладбища — бензохранилище.
В 1995 году Крестовоздвиженский собор, колокольный и монашеский корпуса были переданы Нижегородской епархии. Первым храмом возрождаемой обители стала домовая церковь в честь новомученицы Великой Княгини Елисаветы (1997 год).
В праздник Воздвижения Креста Господня 1999 года состоялось первое богослужение в Крестовоздвиженском соборе.
В 2004 году Священный Синод благословил возобновление монашеской жизни в Крестовоздвиженском монастыре. Настоятельницей обители стала инокиня Татиана (Гажу). В 2006 году Преосвященным архиепископом Георгием инокиня Татиана была пострижена в мантию с именем Филарета. В 2006 году в Крестовоздвиженском монастыре были проведены исследования в усыпальнице монастыря. В результате исследований были обретены останки шести игумений (из семи), управлявших обителью до разорения.
Богослужения в монастыре совершаются согласно церковного устава ежедневно. Количество молящихся в храме — от 20 в будние дни до 350 в праздники.
При монастыре действует воскресная школа, где обучаются 35 учащихся. Монастырь оказывает благотворительную помощь детскому интернату.
В июне 2006 года при монастыре открыт Медицинский центр Нижегородской епархии.