Монастырь расположен близ Новгорода на левом берегу реки Волхов, в устье Княжева ручья. По словам историка Татищева, Юрьев монастырь - древнейший на Русской земле. В 1030 г. князь Ярослав Мудрый (в крещении - Георгий) выстроил здесь деревянную церковь во имя святого Георгия. В 1092 г. монастырь был расширен, а в 1119-1130 гг. при святом Всеволоде деревянную церковь сменили каменным храмом. Неоднократно обитель подвергалась различным бедствиям - пожарам, нашествиям врагов. К концу XVIII в. монастырь сильно обветшал и начал приходить в запустение. Но с помощью деятельности по благоустроению архимандрита Фотия и значительных денежных вкладов гр. Орловой-Чесменской, камерфрейлины Двора Их Императорских Величеств, монастырь был великолепно украшен. В нем были возведены 8 храмов. Самый грандиозный - собор во имя великомученика Георгия - один из лучших образцов архитектурного стиля XII века. Собору было подарено царем Михаилом Феодоровичем четырехъярусное медное паникадило. В его алтаре на горнем месте стояло стальное кресло императора Петра I. Блистали богатством внутреннего убранства и другие храмы обители: в честь Всех святых; Похвалы Пресвятой Богородицы; святителя Алексия, митрополита Московского; Воздвиженский; в честь иконы Божией Матери «Неопалимая Купина»; во имя Архангела Михаила. В монастыре находятся могилы князей Димитрия Шемяки, Ростислава, Изяслава и Феодора Ярославичей. В усыпальнице церкви Похвалы Пресвятой Богородицы были погребены архимандрит Фотий и гр. Орлова-Чесменская, завещавшая все свое миллионное состояние Юрьеву монастырю. До XVIII века обитель считалась одной из самых богатых на Севере и была называема лаврой. Монастырские владения доходили до Белого моря. К обители был приписан Перынский скит, расположенный в 1 км от монастыря у истока реки Волхов. Здесь в 995 году первый новгородский епископ Иоаким на месте прежде стоявшего идола Перуна воздвиг церковь Рождества Богородицы. Упраздненный было в 1764 г. скит был вновь восстановлен и отдан обители.

Во время Великой Отечественной войны Георгиевский собор безуспешно взрывали. Сегодня он нуждается в реставрационных работах.

Множество чудес было явлено в монастыре в последние годы: мироточение иконы в Крестовоздвиженском соборе, чудесное явление иконы «Неопалимая Купина», благоухание мощей.