Часовня Рождества Божией Матери в Научно-Исследовательском Институте Акушерства и Гинекологии им. Д.О.Отта построена по проекту А.Н.Бенуа и освящена при открытии института в 1904 г.

После прихода богоборческой власти часовня была закрыта в 1926 г. Благочестивым сотрудникам удалось спасти от уничтожения витраж Божией Матери - творение замечательного русского художника Васнецова, сейчас он находится в алтаре храма Смоленской иконы Божией Матери на Смоленском кладбище. В Советское время в помещении часовни была устроена больничная палата.

В 1992 г., по инициативе директора института, Э.К.Айламазяна, началась реставрация интерьера часовни в соответствии с ее прежним обликом.

Была восстановлена точная копия витража, которая и ныне является центральным украшением храма.

9 марта 1994 года с благословения Высокопреосвященнейшего Иоанна митрополита Санкт-Петербургского и Ладожского был образован приход, первым настоятелем которого становится священник Кирилл Копейкин, выпускник Санкт-Петербургской Духовной Академии.

Тогда же в часовне начали совершаться богослужения и она обрела статус домового храма.

3 июня 2004 года, Указом Высокопреосвященнейшего Владимира, митрополита Санкт-Петербургского и Ладожского, настоятелем прихода назначен протоиерей Евгений Палюлин, также выпускник Санкт-Петербургской Духовной Академии, ранее занимавшийся социальной работой в Вологодской епархии.