Церковь Сергия Радонежского и Никандра стоит у самых стен Изборской крепости.

По простоте она напоминает каменный жилой дом с двускатной крышей. Над коньком поднимается декоративная главка. Главное украшение храма — двухпролетная звонница, которая играет роль главного фасада здания.

Это бесстолпный адноапсдный храм с приделом. С западной стороны к нему пристроен притвор с крыльцом и звонницей. Эта звонница удивительно красива. Игорь Грабарь в своей «Истории русского искусства» писал о ней: «Иногда и в звонницах псковичи достигают впечатления сурового величия и исполинской мощи:, но чаще всего это очаровательные небольшие сооружения, создания немудреного ума, но поистине теплого чувства, проникнутые тонкой поэзией и чутьем прекрасного. Такова звонница у крепостной стены в Изборске, одиноко стоящая среди чудесного пейзажа и играющая на фоне бархатной зелени деревьев своими стройными формами».

Первоначально существовала деревянная церковь Сергия и Никандра. Точная дата первоначальной постройки неизвестна, но после присоединения к Москве на Псковской земле начинают почитаться и Московские святые. Можно предположить, что церковь во славу не местных святых строиться в XVI веке. В описях города она упоминается впервые в 1584 году. Затем деревянная церковь сгорела, новый храм был воздвигнут в период между 1701 и 1755 годами.

В 1979 году ансамбль завершился строительством вокруг церкви небольшой плитняковой ограды, ворота с одним арочным проемом, о чем свидетельствует надпись на вкладной плите в воротах.

До 1831 года церковь Сергия и Никандра имела свой приход и священника с дьячком. Чуть позднее она была приписана к Никольскому собору, богослужения стал проводить соборный священник. Действующим он был до конца шестидесятых годов затем церковь была закрыта и здание передано музею.