В 1848 году епископ Саратовский и Царицынский Афанасий (Дроздов) приобрел участок в 16 га с садом и рощей для архиерейской дачи в 4 верстах от города позади мужского Спасо-Преображенского монастыря. Со временем на этом месте возник мужской скит, называемый Верхней Монастыркой. В 1882-1889 годах построен храм во имя святителя Алексия, митрополита Московского.
В 1918 году Свято-Алексиевский скит закрыт. Храм частично разрушен, уничтожены 5 куполов и звонница. Сад одичал и по большей части вырублен, родник замурован. На территории скита находился детский санаторий, больница.
В 1991 году постройки скита возвращены верующим, на территории создан женский скит. В 1992 году, в праздник Воскресения Христова, в храме скита состоялось первое богослужение. В 1997 году скит преобразован в монастырь.
------------------------------------
Домовая церковь Алексия, митрополита Московского устроена в двухэтажном кирпичном корпусе, построенном в 1880-х годах при епископе Саратовском Павле (Вильчинском).
В 1920-х годах храм закрыт, венчания сломаны, в здании помещалась гинекологическая больница.
В 1991 году здание возвращено верующим, отремонтировано. Обустроена церковь, в 2000 году устроен второй престол Анны Кашинской.
Церковь Иконы Божией Матери Смоленская построена в 1995-2008 годах. Храм освящен 4 декабря 2008 года. С 2011 года в цокольном этаже престол Младенцев Вифлеемских.