Храм во имя святого праведного Иоанна Кронштадтского построен в 1992 году на средства Казанской епархии РПЦ. Первоначально предполагалось открыть часовню с прилигающими к ней зданиями Воскресной школы и благотворительной столовой для малоимущих.
Но когда было принято решение о воссоздании Казанской Духовной Семинарии здание часовни было реконструировано под церковь (увеличена площадь и надстроена колокольня).
В здании Воскресной школы разместилась Семинария. Освящение храма было совершено епископом Казанским и Татарстанским Анастасием 20 декабря 1996 года. Несмотря на то, что храм довольно молодой в нем хранятся многие почитаемые верующими святыни: мощи преподобного Гавриила Седмиезерного, древний образ Смоленской-Седмиезерной иконы Божией Матери, чтимые иконы Ростовских чудотворцев, Первосвятителей Московских и Трех Святителей (Василия Великого, Григория Богослова и Иоанна Златоуста) и другие.
В храме Духовной Семинарии служат преподователи и учащиеся имеющие священный сан.
Воспитанники Духовной Школы в храме проходят практику клиросного и пономарского послушания, участвуют в богослужениях.