Остров Столобное, название которого увековечил и прославил на весь христианский мир прп. Нил, Столобенский чудотворец, стал после блаженной кончины святого местом паломничества богомольцев. В 1594 г. была открыта обитель, получив наименование Нило-Столобеиской пустыни. Первым настоятелем (строителем) монастыря был поставлен иеромонах Герман.

При строительстве каменного Богоявленского собора в мае 1667 г. земля вдруг осыпалась и открылись святые мощи преподобного. Они торжественно перенесены в храм в 1669 г. Мощи почивали в серебряной позолоченной раке, устроенной в 1764 г. При мощах хранилась мантия святого, а также чудотворная Владимирская икона Божией Матери, по месту явления чудес названная также Селигерской. Принесенная на остров прп. Нилом, она всегда находилась в его келье и потому стала именоваться еще и Келейной.

Монастырь являлся образцом иноческого быта. Из Ниловой пустыни вышли некоторые высшие иерархи Русской Православной Церкви: инок Евфимий в конце XVII в. был митрополитом Новгородским, инок Иоасаф с 1725 г. - епископом Воронежским и т. п. Перед революцией в Ниловой пустыни было 17 иноков, 37 послушников, 7 священнослужителей, 17 работников и 68 трудников.

Велико значение Нило-Столобенской пустыни как культурно-просветительного центра. В монастыре сформировалось богатейшее книжное собрание, которое стало первой библиотекой в регионе Верхней Волги. С Ниловой пустынью связано создание архивной службы и монастырской ризницы, фактически явившейся первым музеем в регионе Верхней Волги. В 1807 г. здесь открылась русская школа для сирот из семей священнослужителей. В ней на полном обеспечении находилось 50 детей, они учились чтению, письму, изучали Закон Божий, арифметику, историю, географию и другие предметы.

Нилова пустынь - уникальный культурно-природный комплекс. Культурные ландшафты монастыря, к которым относится липовый парк с Воздвиженской аллеей, комплекс фруктового сада, Набережная аллея, цветники на территории гостиного двора, мемориальные зоны (пещеры и дуб преподобного и т. д.), инженерно-технические сооружения (гранитная набережная, система волнорезов, садковые озера, канал Копанка и др.) гармонично сочетались с природной средой.

После революции Нилова пустынь продолжала существование еще до 1927 г.

В начале 90-х годов наступило время ее возрождения. Из храмов пустыни сохранились: Богоявленский собор, надвратный храм прп. Нила, храм свв. апп. Петра и Павла, Крестовоздвиженский храм и храм Всех святых. Действует пока только боковой придел Богоявленского собора.

Большим и радостным событием в Ниловой пустыни явилось возвращение мощей преподобного из Знаменского собора г. Осташкова в Богоявленский собор монастыря на Столобном о-ве. Торжественное перенесение святыни состоялось 9 июня 1995 г. по благословению и при участии Патриарха Московского и всея Руси Алексия II и множества народа. Насельники обители прп. Нила, Столобенского чудотворца, также почтили память святого, установив летом 1997 г. крест на горе в юго-западной части о-ва Столобное, в том месте, где была пещера преподобного.

Возобновлена традиция совершать 27 мая/9 июня, в день обретения мощей прп. Нила, крестный ход из Осташкова в обитель.

------------------------------------

Фотографии сделаны с колокольни монастырского Храма: