Монастырь основан в 1314 году епископом Ростовским Прохором на месте обретения иконы Богоматери как мужской монастырь. Каменные стены с башнями и большинство келейных корпусов построены в конце 17 века попечением игумена Гордиана.

В 1928 году монастырь закрыт. Здания монастыря использованы под жилье. С 1936 года на территории монастыря размещена детская колония.

В 1987 году монастырь открыт как женский.

------------------------------------

Собор Введения Пресвятой Богородицы во Храм построен в 1681-1683 годах попечением игумена Гордиана вместо прежней церкви постройки конца 16 века. Придел Ярославских Чудотворцев. В 1680-х годах построена трёхъярусная звонница, в 1825-1826 годах надстроена двумя ярусами.

В 1928 году церковь закрыли. В здание храма размещались лаборатории Волгостроя, позже склад.

Храм освящен в 1992 году.

Надвратная Церковь Николая Чудотворца над западными воротами построена и освящена в 1672 году на средства купцов С. М. и И. М. Сверчковых. В 19 веке крестовый храм при архиерейских покоях.

После закрытия в 1930-х годах здание церкви занято под жилье, сломана глава.

В 1997 году церковь освящена.

Церковь Спаса Нерукотворного Образа при монастырских больничных кельях построена в 1710-е годы. В трапезной придел Димитрия Ростовского (до 1798 года праведного Лазаря).

В 1928 году храм закрыт. Здание церкви занято службами и водокачкой.

В 1988 году в церкви возобновлены богослужения.

Трапезная церковь Воздвижения Честного Креста Господня построена в 1620-е годы на средства царя Михаила Федоровича. Перестраивалась в 1670-х и в 1837-1838 годах. В 1735 году пристроен Толгский придел. В 1867 году в алтаре устроен Александро-Невский придел.

В 1928 году церковь закрыли. Здание храма занято под кинотеатр. К 1980-м годам церковь заброшена, частично обрушились своды.

В 1990-х годах отреставрирована. В 1999 году церковь освящена. В 2006 году а подклетном этаже устроен Варваринский храм.

Часовня на могиле 46 иноков и служителей монастыря убитых во время разгрома в 1609 году поляками построена в 1893 году.

В советские время в часовне размещался склад ГСМ.

Надкладезная часовня Трифона, епископа Ростовского построена в 2000-2001 годах.