Деревянная церковь в Мотохове была выстроена в 1701 году. В 1755 году церковь сгорела и была возобновлена в 1756 - 1757 годах.

Каменная церковь с приделами святого великомученика Георгия и Покрова Пресвятой Богородицы была сооружена в 1847 - 1852 годах по проекту архитектора Д. Г. Гейденрейха (есть вероятность, что строили храм вологодские каменщики).

Деревянный храм к 1899 году обветшал и был разобран.

Каменная церковь была закрыта в 1939 году. Здание её сохранилось.