Кафедральный (главный храм Московской епархии, возглавляемой Патриархом Московским и всея Руси Алексием II).

Coopужён в 1835—45 (арх. Е. Д. Тюрин) в пригородном селе Елохове («елох» — ольха) на месте одноименного каменного храма, который был построен вместо ранее существовавшего деревянного храма в 1722—31, в основном на средства царевны Прасковьи Ивановны при содействии Петра I; в 1799 в нем крещен А. С. Пушкин. От этого храма сохранились перестроенные в 1792—93 трапезная и первый ярус колокольни. В первой четверти XIX в. построены верхние 3 яруса колокольни, в 1889 купол и аттик (стенка над карнизом) над трапезной (арх. П. П. Зыков). Собор обновлялся в 1895. Ограда — XIX в.

Грандиозный (вмещает несколько тысяч молящихся), кубообразный храм в стиле классицизма. Увенчан 5 главами. Над карнизом — мощный аттик, создающий как бы ступенчатый переход к ансамблю куполов, вокруг барабанов (оснований глав куполов) колоннады.

Центральный барабан с окнами, освещающими сверху храм; четыре барабана по его бокам и барабан над трапезной — глухие, в них находятся служебные помещения. На хоры (у северо-запада барабана) ведет четырехэтажный лифт. Колокольня — четырехъярусная. Колокола на ней сохранились (большой колокол — 1900, из храма святителя Николая Чудотворца в Пыжах, куплен в Большом театре после того, как треснул соборный колокол).

В соборе главный престол — Богоявления, приделы: южный — Благовещения Пресвятой Богородицы, северный — святителя Николая Чудотворца (освящен вместе с трапезной в 1912, стены расписаны В. П. Гурьяновым). В соборе — пятиярусный вызолоченный иконостас.

После 1917 не закрывался. В середине 1930-х, после разрушения Патриаршего храма Богоявления в Дорогомилове, в собор была перенесена кафедра Патриаршего местоблюстителя митрополита Московского и Коломенского (с 1943 — Патриарха) Сергия (Страгородского). С начала 1992, после возвращения Церкви Успенского собора в Кремле, ставшего Патриаршим, собор — кафедральный (здесь находится кафедра главы Московской епархии Патриарха Московского и всея Руси Алексия II).

Святыни. Особо чтимый список чудотворного Казанского образа Божией Матери; на клиросе, с юга от царских врат, под особой сенью в раке мощи святителя Алексия, митрополита Московского (до 1928 находились в кремлевском Чудовом монастыре, после его разрушения в 1928—47 — в Архангельском соборе Кремля); в Никольском приделе — гробница Патриарха Сергия (ум. 1944) с надгробием.

К собору приписан храм великомученика Никиты в Старой Басманной.

Крестильный храм святого Василия Блаженного находится во дворе собора Богоявления. Основан как храм в послевоенные годы. Свое название получил в связи с тем, что в декабре 1468 в приходе находившегося в селе Елохове храма в честь Владимирской иконы Божией Матери (разобран в XIX в.) родился блаженный Василий, Христа ради юродивый, Московский чудотворец.

При храме — воскресная школа с изучением церковного пения, сестричество равноапостольной Марии Магдалины, проводятся посещения больных в 6-й Басманной больнице.

При соборе - крестильный храм Василия Блаженного