Церковь упоминается в 1719 году, тогда село называлось Космодемьянским. В 1789 году упоминается церковь Космы и Дамиана. В 1815 года упоминается в селе Новом Кряжиме.

Николаевская церковь в Новом Кряжиме построена в 1830 году на средства прихожан. Церковь деревянная холодная с тёплой трапезной и колокольней. В трапезной придельный престол во имя святых Бессребренников и Чудотворцев Косьмы и Дамиана. На территории храма сторожка и дом священника.

В советское время церковь закрыли. Храм не сохранился.

В 1992 году в селе зарегистрирована православная община. В старом деревянном здании больницы обустроен Космодамиановский молитвенный дом.

Новая кирпичная церковь во имя святителя Николая, архиепископа Мир Ликийских, Чудотворца построена в 2000-х годах. 25 июня 2011 года церковь освящена.