В 1563 году упоминается деревянная Никольская церковь. В 1628-1629 годах упоминается деревянная клецкая Никольская церковь. В 1775 году церковь сгорела, в том же году с благословения епископа Переславского Антония построена новая деревянная церковь во имя Николая Чудотворца.

Каменная церковь Николая Мирликийского в Копнино построена в 1815 году. Храм с тёплой трапезной и колокольней. Придельные престолы в трапезной Преподобного Сергия Радонежского и Казанской иконы Божией Матери.

В 1804 году назначен священником Гавриил Иванович Цветков после окончания богословского отделения Владимирской духовной семинарии, умер в 1837 году. На 1873 год приход Николаевской церкви состоял из села, в котором числилось 160 ревизских душ, и деревень Измайлово (73 души), Свечино (148), Мериново (78), Желтиково (104), Селезнёво (100), Федосово (67), Бахмурово (36). Всего в приходе числилось 766 ревизских душ. В 1876 году в Никольской церкви служили священник Феодор Белоярое, диакон на псаломщицкой вакансии Сергий Смирнов и пономарь Николай Архангельский.

В советские годы церковь закрыли.

Храм возвращён верующим.