Церковь располагалась в надстройке на крыше здания. Имела высокое завершение (купол с главкой). Сохранилась только нижняя часть этой надстройки. Перед фасадом здания стояла небольшая звонница.

Здание бывшего Варваринского сиротского приюта для девочек, оставшихся без родителей после холеры 1848 г., основан почетным гражданином действительным статским советником Алексеем Ивановичем Лобковым (? - 1868) и назван по имени его умершей дочери Варвары (Понырко). Почетный гражданин Алексей Иванович Лобков изъявил Московскому военному генерал-губернатору готовность пожертвовать, на призрение бедных сирот, принадлежащие ему в Серпуховской части, деревянный дом, с приспособлением его к помещению заведения, и сверх того представил тридцать тысяч рублей серебром единовременно, и обязался вносить по тысяче рублей в течение первых пяти лет.

Здание 18 века перестроили для приюта в 1849 г. по проекту Михаила Дормидонтовича Быковского (1801 - 1885). Особенностью приюта был обширный сад, занимавший 4 гектара к югу от Варваринского переулка. В 1850 г. по заказу Лобкова выстроено новое здание с церковью великомученицы Варвары (освящена в 1855 г.).Приют был одним из первых в городе частным воспитательно-учебным заведением. В приюте на полном обеспечении жили девочки, которые остались сиротами после смерти неимущих родителей, получая там начальное образование и навыки рукоделия и домашнего хозяйства.

После революции приют был преобразован в детский дом имени Некрасова. В 1919 году здание было реквизировано для строящейся радиостанции (впоследствии "Новый Коминтерн"). В 1938-1967 годах здесь находился Телецентр СССР.