Первый храм в селе Пересыпкино построен в 1765 году. Деревянная церковь крытая тёсом, звонницы не было. Колокола весели на толстой дубовой перекладине, державшихся на толстых дубовых столбах. В 1843 и 1895 годах церковь перестраивалась. Приделы в честь Казанской иконы Божией Матери и Михаила Архангела. При храме церковно-приходская школа.

В 1930-х годах церковь закрыли. В 1947 году Богослужения возобновились. В 1962 году снова закрыта. В разное время в здании храма размещались склад зерна и сельский клуб. В 2006 году церковь сгорела.

В 2009 году построена новая Богоявленская церковь на месте старой.